Ngày 29/10/1991, Chủ tịch Hội đồng Bộ trưởng (nay là Thủ tướng Chính phủ) ban hành Quyết định số 352/CT về việc phê duyệt luận chứng kinh tế kỹ thuật Vườn quốc gia Yok Don. Ngày 24/6/1992, Bộ Lâm nghiệp (nay là Bộ Nông nghiệp và PTNT) ban hành Quyết định số 301/TCLĐ về việc thành lập VQG Yok Don. Ngày 18/03/2002, Thủ tướng Chính phủ ban hành Quyết định số 39/2002/QĐ-TTg về việc mở rộng Vườn quốc gia Yok Don, tỉnh Đắk Lắk. Vườn quốc gia Yok Don thuộc địa giới hành chính các xã: Ea Bung, Cư M’Lan huyện Ea Sup, xã Krông Na, huyện Buôn Đôn, tỉnh Đăk Lắk và xã Đắk Wil, huyện Cư Jut, tỉnh Đắk Nông. Ban quản lý Vườn quốc gia Yok Don trực thuộc Tổng cục Lâm nghiệp, Bộ Nông nghiệp và PTNT.
Vườn quốc gia Yok Don phân bố trong khu vực có điều kiện tự nhiên khô nóng, đã tạo ra những đặc trưng của hệ thực vật với cấu trúc là rừng thưa cây lá rộng rụng lá theo mùa với ưu thế của cây họ Dầu (rừng khộp); là sinh cảnh sống của nhiều loài động vật hoang dã, đặc biệt là những loài thú lớn như: Voi Châu Á, Bò tót, Nai cà tông, Mang,...
Đã ghi nhận 1.006 loài thực vật; trong đó, có 85 loài thực vật trong Sách đỏ Việt Nam năm 2007. Nhiều loài có giá trị kinh tế và bảo tồn cao như: Trắc (Dalbergia cochinchinensis), Cà te (Afzelia xylocarpa), Cẩm lai (Dalbergia cochinchinensis), Giáng hương (Pterocarpus macrocarpus), Chiêu liêu đen (Terminalia alata Heyne ex Roth),...
Đã ghi nhận 650 loài động vật; trong đó, có 92 loài Thú, 373 loài Chim, 55 loài Bò sát, 18 Lưỡng cư và 112 loài Cá; có 63 loài trong Sách đỏ Việt Nam năm 2007, 50 loài thuộc Nghị định số 06/2019/NĐ-CP và 25 loài đặc hữu của Vườn. Một số loài động vật quý hiếm điển hình như: Voi (Elephas maximus), Bò rừng (Bos javanicus), Bò tót (Bos gaurus), Hươu (Cervidae), Nai (Rusa unicolor), Gà lôi (Lophura), Công (Pavo muticus), Sáo (Sturnidae), Phượng hoàng,…
Vườn quốc gia Yok Don có dòng sông Srêpôk huyền thoại chảy qua và tạo thành các dòng suối, ghềnh, thác hùng vĩ, khí hậu trong lành tạo nên những điểm tham quan đẹp, hấp dẫn du khách. Một số tuyến, điểm và hoạt động du lịch hấp dẫn như: chinh phục đỉnh Yok Don; Thác Bảy Nhánh, Thác Phật; bơi lội, câu cá tại suối Đắk Ken, Đắk Lau, Đắk Te; trải nghiệm một ngày làm Kiểm lâm; khám phá bản sắc dân tộc trong các buôn làng Tây Nguyên,…
